在大量资金投入科研建设平台的同时，华西医院努力从体制上保障科技发展不因人的位置的变化而兴废，换句话说，科研平台或项目不能建成领导的“后花园”。这一点与很多医院的操作有所不同。在10多年里，华西医院的科研投入只用于那些具有前瞻性、具有市场转化潜力的课题，而绝不以谁的“帽子高”为标准。正是这一原则，进一步激发了大家的创新意识。

2011年年末，华西医院胸外科主任刘伦旭教授用近10年时间创造的一项现代医学新技术——单向式胸腔镜肺叶切除术，在全省科技进步奖评审中以全票通过被评为一等奖。过去，全球医学界普遍认为，直径超过5厘米的肿瘤就不能进行胸腔镜手术，但刘伦旭的新技术突破了这个“禁区”。至今他已成功运用新技术切除了超过5厘米的肿瘤40多例，其中最大的达12厘米。他甚至在一次手术中为一名双肺患有四个原发性肺癌的70岁女性患者切除双侧肺癌，完成了国际上首例同期双侧单孔胸腔镜手术治疗同时性多原发肺癌。“这是近年来我国少有的创新技术，是新世纪微创胸外科的重要进展。”中国医师协会胸外科医师分会会长王天佑如是评价。

在华西医院，还有很多像刘伦旭这样勇闯科学禁区，在医学科学上迈入国内国际前列的医务科研人员。与北京、上海、广东的大医院相比，虽然地处内地，华西医院却在过去10多年里引进了近30名顶级专家。同时，该院还大力培养内部人才，给予他们施展科研才华的空间。如今，华西医院已拥有两院院士、长江学者、国家杰出青年基金获得者等人才团队，他们所创立的科研项目和攻克的医学难关，都剑指国内首创或国际第一。