内源控制技术即清淤疏浚技术，通常有两种：一种是抽干湖/河水后清淤；另一种是用挖泥船直接从水中清除淤泥。

城市黑臭水体的水质净化技术主要包括：人工曝气充氧、絮凝沉淀技术、人工湿地技术、生态浮岛、稳定塘等。

水动力改善技术对于纳污负荷高、水动力不足、环境容量低的城市黑臭水体治理效果明显。但调用清洁水来改善河水水质应尽量采用非常规水源，同时在调水的过程中要防止引入新的污染源。

生态恢复技术包括城市河道富营养化的控制（关键在于磷的控制）技术、藻类生长人工控制技术，以及水生态修复技术。