挑战二：盲目竞争产业同构 要素错配资源浪费

长江经济带的许多地区以拼地价、拼税收优惠、拼补贴等来争夺投资，“门槛降无可降，成本一减到底，空间一让再让”，竞争达到了非常惨烈、白热化的程度。同时，各地并未科学结合本地区的要素禀赋和比较优势，盲目追求所谓经济效益高的产业，结果导致重复投资，产业结构趋同，有的地方招进了所谓“高大上”的产业，但本地资源严重不匹配，最后导致项目“烂尾”的不在少数。这种产业同构使分工与协作难以发展起来，不能形成梯度层次，反而恶化竞争，产业同构化导致地方的资金、劳动力等被这些重复的产业所占用，而没有利用在当地更具有效益优势的产业，导致了大量的要素错配和极大的资源浪费。

挑战三：行政壁垒阻碍流动 产业升级成本变高

以省级行政单位为主体实施的行政区域内保护性经济政策以及其所形成的事实上行政壁垒，阻碍了区域间的生产要素和产品的自由流动，影响了大区域（长江经济带）间产业转移和产业升级优化，降低了地区间产业分工和协作的效率。由于地区保护，正常的产业“雁形发展”过程被阻隔。如一些劳动密集型产业应当从东部长三角地区向中西部转移，从而置换出空间实施产业转型升级，但由于有的地方政府为了保短期增长和就业指标，通过财政补贴、税收优惠和行政干预等措施，阻拦了这些产业的转移进程。产业转移缓慢或不足带来的问题较多，其中最主要的是不利于中西部地区城镇化水平的提高，而沿海地区因空间的紧缺和人口的拥挤导致房价过高，从而造成城镇化和产业升级的成本过高。